两者的核算时间不同
固定资产折旧的计提是按月进行的，并根据用途分别计入相关的成本或当期费用，属于因正常时间推移在不同会计期间的成本或费用，具有系统性和关联性；而固定资产减值准备的核算通常是在年末或指定的核算期末根据实际情况来进行，在并无证据表明减值已发生的情况下，一般不必作帐务处理，因此不同会计期间的减值损失与时间推移或正常使用之间并不存在必然的系统的联系。
两者的计提方法不同
企业根据固定资产所含经济利益的预期实现方式来选择折旧方法，可以采用年限平均法、工作量法、年数总和法、双倍余额递减法等。
除固定资产包含的经济利益的预期实现方式有重大改变，可相应改变固定资产折旧方法外，一般折旧方法一经选定，不得随意调整；而固定资产减值准备的计提，没有象折旧那样有多种可选择的方法，它主要是于期末通过对固定资产可收回金额与其帐面价值的估价、分析比较、判断来进行计提的。
两者的计提基数不同
固定资产折旧是以原值减去预计净残值的余额作为折旧基数，并在预计使用寿命的折旧年限内计提折旧的。固定资产如果已计提了减值准备，则应当按照该固定资产的帐面价值（即固定资产原价减去累计折旧和已计提的减值准备）以及尚可使用寿命重新计算确定折旧率和折旧额；如果已计提减值准备的固定资产价值又得以恢复，则应当按照固定资产价值恢复后的帐面价值以及尚可使用寿命重新计算确定折旧率和折旧额。应当注意的是因固定资产减值准备而调整固定资产折旧额时，对此前已计提的累计折旧不作调整。
可见，固定资产原值、预计使用寿命、预计净残值等都是事先确定好的，属于带有一定主观性的会计估算。而固定资产减值准备则是针对固定资产帐面价值而言的，在期末时按帐面价值与可收回金额熟低的原则来计量，对可收回金额低于帐面价值的差额计提固定资产减值准备。而可收回金额是依据核算日前后的相关信息确定的，不可事先确定。可见，相对折旧而言，固定资产减值这种估算是事后的，客观一些，不同时间计提的减值准备金额具有不确定性。
两者的纳税影响不同
《企业所得税税前扣除办法》第22条规定，企业经营活动中使用的固定资产折旧费可以在税前扣除，不过接受捐赠和盘盈的固定资产，虽然会计上按会计核算的配比原则允许提取折旧，但由于企业没有支付任何代价，所以在企业所得税上也就不能扣除任何折旧费用。
新《企业会计制度》在原有四项减值准备的基础上，按照谨慎性原则，结合国际惯例，又新增了包括计提固定资产减值准备在内的四项减值准备。而《企业所得税税前扣除办法》早就明确规定：在计算应纳税所得额时，存货跌价准备、短期投资跌价准备、长期投资减值准备、风险准备基金（包括投资风险准备基金）以及国家税收法规规定可提取的准备金之外的任何形式的准备金都不得扣除。这就表明无论企业采取什么样的资产减值准备政策，在税收法规上均不予承认，从而避免对所得税的冲击。可见，企业计提固定资产减值准备是不得在税前扣除的，它对所得税数额没有影响，但是因为固定资产减值准备的提取，会影响折旧数额的变化，因此会形成纳税的时间性差异。
两者的帐务处理不同
固定资产的折旧与日常经营管理息息相关，是经常发生的，所以其折旧额直接体现在企业的经常性费用中，提取时借记“制造费用”、“管理费用”等科目，贷记“累计折旧”科目，并且在一般情况下不存在冲回问题；而固定资产减值准备的提取与企业日常经营管理无直接关联，导致减值的情形也并非是经常发生的，因而减值准备的计提时，借记“营业外支出——计提的固定资产减值准备”科目，贷记“固定资产减值准备”科目。
在此后的期间，若表明固定资产发生减值的迹象全部消失或部分消失，则应在原已计提减值准备的数额范围内转回，借记“固定资产减值准备”科目，贷记“营业外支出——计提的固定资产减值准备”科目。
尽管固定资产减值与折旧有着上述种种区别，但它们也不是孤立的，而是彼此联系，相互影响的。累计折旧额的大小会影响固定资产减值准备计提数额的多少，而固定资产减值准备的提取，也实实在在地通过改变折旧的计提基数而影响折旧额的高低。
另外，它们还反映了这样一种关系：“原值”减去“累计折旧”等于“净值”，“净值”再减去“减值准备”等于“固定资产的帐面价值”。这最后得出的“帐面价值”，可以理解为此时此刻该项固定资产的可收回金额。所以从这个角度来看，“固定资产减值准备”也是“累计折旧”的修正与补充，它们共同反映着固定资产的现时价值。
