税收征管成本核算体系是税收管理部门运用成本核算的方法，通过对税收征收管理过程中发生的人、财、物等成本费用进行分解、归集、核算，进而分析成本的规模、结构、效益等，为控制税收征管成本、提高征管效率提供依据的一整套核算流程。
核算体系的基本内容
税收征管成本核算体系的基本内容应该包括：税收征管成本的核算主体、核算对象、核算方法以及对核算结果的分析与评价。
一是成本核算主体。按照目前的税务部门及机构设置，税收征管成本核算的主体主要为财务管理部门（或办公室）和其他分管具体业务的业务管理部门。参照企业成本管理的模式，我们可以将与税收征管活动直接相关的业务管理部门比作是“产品生产部门”，而将办公室、财务科（处）、人事科（处）、监察室等与税收征管活动没有直接相关的部门归为“后勤服务部门”。“产品生产部门”(业务管理部门)发生的成本费用可直接或费用归集后归入到具体税种、地区的税收征管成本上，类似于企业车间的“生产成本”。“后勤服务部门”发生的维持日常机构运转、与税收征管活动没有关联的费用支出，如办公费用等则不能归入税收征管成本，类似于企业管理活动发生的“管理费用”。但对于辅助性的征管成本或公共成本，例如办公室发生的由于纳税服务宣传发生的费用，则属于全局性的费用支出，类似于企业的“制造费用”，是可以进一步筛选、分配到具体的征管成本对象中去的。
财务管理部门（或办公室）负责税务部门税收征管成本的全面核算与归集工作，同时要将各业务管理及相关部门的成本核算结果进行汇总、整理，形成全局性的税收征收管理成本的核算结果。业务管理部门对本部门内设的各职能分支机构在核算期内发生的人、财、物等税收征管资源的耗费，分别按照成本发生的经济用途进行核算，按照税收征管成本的构成，即人力成本、公务成本、设施建设成本和其他成本等进行归集。同时，省级及省级以下的财务管理部门（或办公室）和业务管理部门除进行本级部门的征管成本核算工作外，还要汇总下一级的核算结果，一并汇总、整理后，向上一级对应的管理部门报送核算结果。
二是成本核算对象。税收征管成本核算对象的确定，界定了其成本核算的空间范围———税收征收管理活动，包括行政管理和税收执法两方面内容，如日常的税务行政、各税种的征收管理、纳税服务、税务稽查及纳税评估等。
三是成本核算方法。由于税收征收管理活动具有行政管理和税收执法两方面的内容，除了包括直接的税种征收管理，还包括了间接的行政管理活动。而税收征收管理活动的“产品”不仅有可以量化的税收收入，还有无法量化的纳税人遵从度、满意度提升等，因此采用作业成本法作为税收征收管理成本的核算方法，比传统的会计核算方法更能体现税收征收管理资源转化为税收收益的理念。
四是成本核算结果的分析与评价。核算税收征管成本，建立横向与纵向指标核算体系，是为了提高税收征管成本核算结果分析的科学性和可操作性，归根结底是为了衡量税收征收管理活动的有效性。
如何开展税收征管成本的核算
税收征管成本核算工作是系统性的工作，并非费用支出的简单记录和汇总。
税收征管成本的核算一般按照以下程序进行：
一要制定预算标准。税收征管部门在编制年度税收征管成本预算时，要对本年度及以前年度的预算执行情况、趋势加以分析，并结合当地经济水平、经济结构、税源分布情况以及税收征管人员增减等实际情况，准确编制预算科目，以加强预算的针对性。还要在量入为出的前提下，对税收征管的具体指标加以量化、细化，在保证正常税收工作开展所必需的人员经费、办公经费的前提下，严格控制税收征管部门“三公经费”、基建等支出规模，不能挤占正常的税收征管费用。在预算执行过程中，要严格按照已确定的预算方案进行，不得突破预算。对于临时出现的大额项目支出或超预算支出，在详实、准确的调查研究基础上，及时上报可行性分析等材料，由上级研究决定是否批准。
二要确定征管成本的核算对象。税收征管成本核算对象是税收征管成本的承担者，是设置成本明细账、分配征管费用和计算征管成本的前提。成本的核算对象可以从不同的角度进行确定，例如按照地区、税种、成本用途、成本发生的部门等。
三要归集分配费用支出。税收征管活动中的费用支出内容复杂且发生频繁，为了能够准确归集，应将全部费用支出进行筛选、分类。筛选是将税收征管成本与税收管理经费分开，分类是按照一定的用途或者经济性质将税收征管成本分成若干成本项目。然后，将各项税收征管成本归集在各项成本明细账中。
四要汇总征管成本并分析核算结果。
在具体的核算汇总工作完成后，应进行征管成本结果的比较、分析，综合运用税收征管成本的衡量指标对各级税收征管部门做出正确评价。比较地区及各税种之间的税收征管成本状况，以分析该年度税收征管成本高低的原因所在。
五要编制决算报表并形成分析报告。及时编制税收征管成本决算报表，并形成税收征管成本分析报告，为下一年度的成本预算编制提供依据，并作为税收征管部门绩效管理的考核、奖惩依据，不断完善税收征管成本会计核算体系的建设。
